More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6831 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  96.48 
 
 		 1049 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  90.45 
 
 		 1049 aa  757    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6831  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 422 aa  866    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  94.97 
 
 		 1049 aa  789    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  69.54 
 
 		 1049 aa  570  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6832  DNA polymerase III, alpha subunit  68.54 
 
 		 961 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.905572  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  68.97 
 
 		 1043 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  56.79 
 
 		 1063 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  56.79 
 
 		 1063 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  56.79 
 
 		 1072 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  56.79 
 
 		 1063 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  56.79 
 
 		 1072 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  56.54 
 
 		 1072 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  56.79 
 
 		 1063 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0445  error-prone DNA polymerase  56.3 
 
 		 1084 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  56.93 
 
 		 1071 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  56.11 
 
 		 1071 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  56.36 
 
 		 1071 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  56.11 
 
 		 1071 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  56.36 
 
 		 1071 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  56.11 
 
 		 1071 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  55.61 
 
 		 1068 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  55.24 
 
 		 1044 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4488  error-prone DNA polymerase  55.08 
 
 		 1079 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458186  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4621  error-prone DNA polymerase  55.08 
 
 		 1079 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743632  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  55.64 
 
 		 1040 aa  419  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0518  DNA-directed DNA polymerase  55.58 
 
 		 668 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0800  error-prone DNA polymerase  54.18 
 
 		 1075 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.338798 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  57.22 
 
 		 1033 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4536  DNA polymerase III, alpha subunit  56.25 
 
 		 1040 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1384  DNA polymerase III, alpha subunit  49.55 
 
 		 1193 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.38254  hitchhiker  0.00082485 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4896  DNA polymerase III, alpha subunit  54.52 
 
 		 1041 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71874  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4523  error-prone DNA polymerase  50.47 
 
 		 1111 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1532  DNA polymerase III, alpha subunit  53.44 
 
 		 1099 aa  398  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0291245  normal  0.633763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  54.76 
 
 		 1047 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3164  DNA polymerase III, alpha subunit  48.07 
 
 		 1195 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789638 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  52.27 
 
 		 1109 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  53.06 
 
 		 1027 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2388  DNA polymerase III, alpha subunit  49.88 
 
 		 1068 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  50.26 
 
 		 1064 aa  365  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  53.35 
 
 		 1023 aa  363  3e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  52.82 
 
 		 1044 aa  362  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1767  DNA polymerase III, alpha subunit  49.62 
 
 		 1061 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  50.76 
 
 		 1076 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  50.13 
 
 		 1026 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  50.51 
 
 		 1031 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4130  error-prone DNA polymerase  55.39 
 
 		 1153 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  50.65 
 
 		 1025 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  48.45 
 
 		 1031 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  50.77 
 
 		 1024 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  48.58 
 
 		 1031 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  47.18 
 
 		 1025 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4261  DNA polymerase III, alpha subunit  47.84 
 
 		 1128 aa  335  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  51.01 
 
 		 1084 aa  335  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  48.07 
 
 		 1026 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  48.47 
 
 		 1026 aa  327  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  47.06 
 
 		 1039 aa  326  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1948  DNA polymerase III, alpha subunit  48.82 
 
 		 1075 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02092  error-prone DNA polymerase  47.33 
 
 		 1083 aa  323  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1028  pantoate-beta-alanine ligase  45.36 
 
 		 1029 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  47.84 
 
 		 1036 aa  323  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  48.59 
 
 		 1026 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  48.33 
 
 		 1026 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  48.33 
 
 		 1026 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1863  DNA-directed DNA polymerase  46.73 
 
 		 1030 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0330088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1095  DNA polymerase III, alpha subunit  50.51 
 
 		 1044 aa  316  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02868  DNA polymerase III alpha chain  45.38 
 
 		 1024 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  43.91 
 
 		 1118 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115871  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  45.15 
 
 		 1082 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003014  DNA polymerase III alpha subunit  44.62 
 
 		 1024 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  47.97 
 
 		 1020 aa  300  3e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1871  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  47.72 
 
 		 1015 aa  299  5e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  44.2 
 
 		 1053 aa  296  4e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  44.13 
 
 		 1085 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  45.64 
 
 		 1090 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  44.69 
 
 		 1087 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  42.42 
 
 		 1087 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1903  error-prone DNA polymerase  42.68 
 
 		 1110 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.989909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  46.67 
 
 		 1096 aa  280  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  44.9 
 
 		 1059 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  44.64 
 
 		 1059 aa  279  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3021  DNA polymerase III, alpha subunit  42.97 
 
 		 1116 aa  277  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2255  error-prone DNA polymerase  43.43 
 
 		 1175 aa  278  2e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  43.11 
 
 		 1074 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4461  DNA polymerase III, alpha subunit  43.47 
 
 		 1117 aa  274  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  43.67 
 
 		 1071 aa  272  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  43.67 
 
 		 1071 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  43.41 
 
 		 1075 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5603  DNA polymerase III, alpha subunit  41.39 
 
 		 1099 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  42.24 
 
 		 1049 aa  268  1e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  44.72 
 
 		 1077 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  41.73 
 
 		 1076 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2666  error-prone DNA polymerase  42.36 
 
 		 1164 aa  266  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466935  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  43.94 
 
 		 1077 aa  266  7e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5157  DNA polymerase III, alpha subunit  42.64 
 
 		 1072 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1123  DNA polymerase III, alpha subunit  43.53 
 
 		 940 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2785  DNA polymerase III, alpha subunit  43.53 
 
 		 940 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.27044  normal  0.619093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3263  DNA polymerase III, alpha subunit  41.65 
 
 		 1126 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2014  DNA polymerase III, alpha subunit  42.53 
 
 		 1096 aa  263  4e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202336  normal  0.139953 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00038  putative DNA polymerase III alpha chain  44.16 
 
 		 986 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>