More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1023 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1023  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  94.47 
 
 		 268 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  89.45 
 
 		 257 aa  359  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4365  transcriptional regulator, DeoR family  54.21 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3564  DeoR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 264 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0635844  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1531  DeoR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6957  DeoR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6298  DeoR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.7128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0561  transcriptional regulator, DeoR family  43.15 
 
 		 254 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.725961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4425  DeoR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612915  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 256 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 268 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2591  DeoR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.759776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  39.2 
 
 		 258 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 274 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  35.8 
 
 		 258 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  35.8 
 
 		 258 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 258 aa  111  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  38.86 
 
 		 255 aa  111  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.14 
 
 		 269 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.33 
 
 		 258 aa  104  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.56 
 
 		 269 aa  102  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.56 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.56 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.56 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.56 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.56 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.56 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  39.88 
 
 		 264 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.56 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.4 
 
 		 269 aa  101  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 257 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 258 aa  98.6  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  31.55 
 
 		 257 aa  98.6  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 264 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3265  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 277 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213162  normal  0.0248717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 278 aa  96.3  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 		 255 aa  94  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  29.38 
 
 		 250 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 260 aa  93.2  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.09 
 
 		 257 aa  92  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.09 
 
 		 257 aa  92  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 268 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.43 
 
 		 258 aa  91.7  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 256 aa  91.3  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  34.98 
 
 		 263 aa  91.3  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  33.52 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  33.52 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.52 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.52 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  33.52 
 
 		 257 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  31.55 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  34.33 
 
 		 261 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 261 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 261 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.52 
 
 		 257 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.41 
 
 		 257 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.09 
 
 		 257 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 		 263 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  34.85 
 
 		 261 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  32.31 
 
 		 261 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.09 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.09 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.09 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 267 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  34.09 
 
 		 257 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  38.25 
 
 		 261 aa  88.6  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  27.87 
 
 		 252 aa  88.6  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4526  DeoR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 253 aa  88.2  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  32.56 
 
 		 250 aa  88.2  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2626  DeoR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 273 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 260 aa  87.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  32.47 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  31.32 
 
 		 263 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  25.99 
 
 		 252 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.39 
 
 		 257 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  30.37 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0673  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.27 
 
 		 269 aa  85.9  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  31.36 
 
 		 255 aa  85.5  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  29.03 
 
 		 257 aa  84.7  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.68 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 261 aa  84.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 255 aa  84.7  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  31.41 
 
 		 254 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 261 aa  84.7  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 255 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  33.71 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>