More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7000 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7000  ROK family protein  100 
 
 		 308 aa  585  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0993  glucokinase  60.42 
 
 		 302 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  58.68 
 
 		 307 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0965  glucokinase  60.07 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  60.07 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  58.53 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10663  sugar kinase  59.01 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.97302e-41  normal  0.432322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  53.02 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  51.17 
 
 		 321 aa  248  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  49.32 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2260  ROK family protein  50.65 
 
 		 304 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149856 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  42.58 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  46.82 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3653  glucokinase  44.62 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4996  glucose kinase  53.51 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0679  ROK family protein  38.19 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8557  glucose kinase  49.06 
 
 		 376 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  35.53 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.19 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  37.38 
 
 		 352 aa  148  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  35.28 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  36.51 
 
 		 314 aa  145  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.06 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.06 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.65 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.65 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.86 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  36.28 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  34.29 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  37.85 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  40.58 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.06 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.19 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  35.14 
 
 		 316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  28.8 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.97 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.44 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  37.66 
 
 		 314 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.08 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  35.4 
 
 		 340 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  34.47 
 
 		 336 aa  132  5e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  34.54 
 
 		 389 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  34.26 
 
 		 332 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  40.19 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  32.59 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.96 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  31.96 
 
 		 327 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.82 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  34.18 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  38.85 
 
 		 312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  38.41 
 
 		 311 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  30.41 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  30.41 
 
 		 297 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.18 
 
 		 298 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  33.23 
 
 		 335 aa  129  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.43 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  36.19 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.33 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.78 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.33 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.63 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  35.96 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  34.64 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  36.33 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  36.66 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.96 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  38.22 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.3 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.56 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.75 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  33.97 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.78 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  36.39 
 
 		 363 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.07 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  37.46 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  28.71 
 
 		 302 aa  123  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  36.25 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  33.96 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  34.08 
 
 		 313 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31 
 
 		 389 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  28.67 
 
 		 292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  28.33 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  34.28 
 
 		 363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  36.84 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  37.54 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  36.36 
 
 		 443 aa  119  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  35.56 
 
 		 314 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  36.36 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  28.44 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  32.32 
 
 		 328 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  33.65 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  36.76 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  26.2 
 
 		 317 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>