More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4996 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4996  glucose kinase  100 
 
 
313 aa  597  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  55.59 
 
 
306 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  52.78 
 
 
307 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  52.84 
 
 
317 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0993  glucokinase  54.17 
 
 
302 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0965  glucokinase  54.17 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  54.17 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10663  sugar kinase  54.58 
 
 
302 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.97302e-41  normal  0.432322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  47.02 
 
 
321 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2260  ROK family protein  53.16 
 
 
304 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.149856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1071  ROK family protein  50.32 
 
 
315 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  38.67 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2663  ROK family protein  49.17 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7000  ROK family protein  52.61 
 
 
308 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8557  glucose kinase  41 
 
 
376 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3653  glucokinase  43.24 
 
 
374 aa  176  5e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0679  ROK family protein  41.23 
 
 
307 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.01 
 
 
322 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.82 
 
 
315 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.82 
 
 
315 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.88 
 
 
315 aa  149  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.95 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  37.46 
 
 
342 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.21 
 
 
327 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.25 
 
 
327 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.25 
 
 
327 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.25 
 
 
327 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.25 
 
 
327 aa  145  9e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.25 
 
 
327 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.25 
 
 
327 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.25 
 
 
327 aa  145  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  36.96 
 
 
303 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  37.25 
 
 
302 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.15 
 
 
323 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  30.55 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.48 
 
 
327 aa  144  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  30.55 
 
 
327 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.66 
 
 
321 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.22 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  35.26 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.59 
 
 
315 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.33 
 
 
314 aa  139  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.33 
 
 
314 aa  139  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  40.5 
 
 
314 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.33 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  34.98 
 
 
340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  32.12 
 
 
316 aa  135  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  36.16 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  33.54 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  33.65 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  35.03 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  38.31 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.92 
 
 
352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  30.03 
 
 
347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.67 
 
 
317 aa  134  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  34.75 
 
 
299 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  29.47 
 
 
317 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  29.04 
 
 
291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  35.91 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.17 
 
 
328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.67 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  31.82 
 
 
318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.03 
 
 
312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  36.51 
 
 
363 aa  129  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  28.71 
 
 
316 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  33.11 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  32.17 
 
 
310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  30.58 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.17 
 
 
313 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.51 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  30.65 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  35.87 
 
 
363 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  37.19 
 
 
314 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.33 
 
 
298 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.53 
 
 
313 aa  125  9e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  34.96 
 
 
335 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.55 
 
 
422 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  35.56 
 
 
336 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  33.21 
 
 
303 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.72 
 
 
302 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  35.35 
 
 
306 aa  124  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  30.84 
 
 
308 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.58 
 
 
297 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  32.81 
 
 
317 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  35.24 
 
 
334 aa  122  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  33.81 
 
 
303 aa  122  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1453  ROK family protein  33.65 
 
 
325 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  35.05 
 
 
324 aa  122  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  31.43 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  30.28 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  30.99 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.9 
 
 
300 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  36.51 
 
 
361 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0698  N-acetylmannosamine kinase  31.42 
 
 
292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000508199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  32.57 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  31.53 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  33.33 
 
 
335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  36.51 
 
 
297 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  34.47 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  28.81 
 
 
303 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>