289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0024 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  295  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  44.87 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  44.23 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  40.38 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  39.74 
 
 
154 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  40.38 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
160 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  38.51 
 
 
153 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  37.42 
 
 
152 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
160 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  35.8 
 
 
160 aa  103  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
159 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
160 aa  100  8e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  31.82 
 
 
155 aa  99  2e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
160 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 
185 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 
159 aa  97.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  51.16 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  36.94 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  33.53 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  38.71 
 
 
165 aa  94.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  36.94 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  34.88 
 
 
174 aa  94.4  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 
160 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
160 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
160 aa  93.6  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 
170 aa  93.6  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  34.39 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
167 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  32.92 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
167 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
160 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  36.25 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  37.84 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 
159 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 
155 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  38.93 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 
159 aa  90.5  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  32.72 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0119  protein of unknown function DUF163  37.5 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  38.46 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  38.46 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 
155 aa  89  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  32.28 
 
 
159 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  88.6  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 
154 aa  88.6  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  38.46 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 
156 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.62 
 
 
147 aa  88.2  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  32.1 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  32.89 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 
159 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  39.74 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  28.03 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  34.18 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  36.71 
 
 
153 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  45.88 
 
 
142 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  31.61 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.54 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  32.5 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  34.36 
 
 
166 aa  84.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  34.36 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 
177 aa  84.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
160 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 
157 aa  84  7e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
162 aa  83.6  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  33.74 
 
 
162 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  30.86 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  35.76 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
159 aa  83.6  8e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  37.1 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>