289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08411 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  322  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  66.88 
 
 		 157 aa  227  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  68.15 
 
 		 157 aa  224  4e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  56.69 
 
 		 157 aa  193  9e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  54.14 
 
 		 157 aa  192  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  56.41 
 
 		 155 aa  179  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  42.68 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  37.42 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  42.31 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  37.42 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  35.48 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  41.77 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  35.9 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  40.88 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  37.82 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  35.26 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  38.22 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  37.82 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  40.43 
 
 		 194 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  38.71 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  36.31 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  35.03 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  35.03 
 
 		 154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  38.06 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 160 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  112  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  37.74 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  31.61 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  31.85 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  39.24 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  36.3 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  36.71 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  36.71 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  33.55 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  36.48 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  30.13 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  34.46 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  32.26 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  31.82 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  31.74 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  38.12 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  31.41 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  35.44 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  30.32 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  30.64 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  34.19 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  29.03 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  29.03 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  29.03 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>