287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2933 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 170 aa  344  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 		 160 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  51.25 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  50.62 
 
 		 160 aa  158  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  53.12 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  46.25 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 		 162 aa  147  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  51.25 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  51.88 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  42.6 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  41.95 
 
 		 174 aa  138  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  42.5 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  43.4 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 		 165 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  42.77 
 
 		 154 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  40.88 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  43.48 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  43.12 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  38.99 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  32.28 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  32.73 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  38.36 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  39.87 
 
 		 152 aa  99  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  30.99 
 
 		 160 aa  98.6  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  38.36 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  44.09 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  27.88 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  27.88 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  34.57 
 
 		 155 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 		 157 aa  94.4  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  36.71 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  39.02 
 
 		 159 aa  90.9  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  40.8 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  30.06 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  42.4 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  27.27 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  34.18 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  34.97 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  32.3 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  41.6 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 147 aa  89  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  31.29 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  40.8 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  36.51 
 
 		 135 aa  88.2  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  41.6 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  30.67 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  33.75 
 
 		 153 aa  87.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  30.38 
 
 		 157 aa  87.8  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  31.1 
 
 		 159 aa  87.4  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  31.1 
 
 		 159 aa  87.4  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  33.12 
 
 		 157 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  40.8 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  29.09 
 
 		 159 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  40.8 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  40.8 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  40.8 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  41.27 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  35.19 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  40.8 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  34.59 
 
 		 142 aa  86.3  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  42.74 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  30.91 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 155 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  39.53 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  30.25 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  29.7 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  33.95 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>