288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_03300 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  100 
 
 
148 aa  298  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  41.45 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  43.42 
 
 
156 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  42.95 
 
 
154 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  40.26 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  41.45 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  40.67 
 
 
156 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  33.55 
 
 
157 aa  103  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 
157 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  37.33 
 
 
157 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  40.91 
 
 
154 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  37.01 
 
 
159 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  38.41 
 
 
155 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  38.78 
 
 
155 aa  100  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  33.97 
 
 
159 aa  100  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  38 
 
 
155 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  35.06 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2563  rRNA large subunit methyltransferase  40.67 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2950  rRNA large subunit methyltransferase  40.67 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  34.87 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  32.43 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  36 
 
 
156 aa  96.7  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  36.18 
 
 
156 aa  96.7  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  38.06 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  38.16 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  35.71 
 
 
159 aa  94.7  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1202  hypothetical protein  36.18 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  35.33 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  35.81 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  38.1 
 
 
145 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  37.42 
 
 
154 aa  93.6  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  39.35 
 
 
153 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  36.18 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  37.82 
 
 
154 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  36.18 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  38.96 
 
 
159 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  32.47 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  32.47 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 
156 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 
166 aa  92  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 
162 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
156 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  37.01 
 
 
177 aa  92.8  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  35.53 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  39.19 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
159 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  32.67 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  34.67 
 
 
155 aa  92  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  35.33 
 
 
156 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  35.46 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  34.67 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004221  hypothetical protein  38.03 
 
 
145 aa  91.3  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000988168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.33 
 
 
156 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  34.87 
 
 
156 aa  90.5  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  35.33 
 
 
156 aa  90.1  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
159 aa  89.4  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  36.18 
 
 
156 aa  89.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  35.57 
 
 
155 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  39.6 
 
 
158 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  36.84 
 
 
156 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
155 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
155 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
155 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  39.19 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
155 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  36 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 
155 aa  89  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  34 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
155 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  32 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.1 
 
 
155 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  34 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  34.21 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  35.1 
 
 
155 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  34.21 
 
 
156 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  35.1 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  35.1 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  33.11 
 
 
156 aa  87.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000336055  unclonable  0.0000000000393257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  34.87 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  31.17 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  42.22 
 
 
155 aa  87.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  34.67 
 
 
155 aa  87.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  34.64 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  34.87 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  34 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 
155 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>