289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2326 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 		 159 aa  211  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 		 159 aa  207  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 		 159 aa  204  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 		 159 aa  202  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 		 159 aa  196  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 		 159 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 159 aa  190  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  53.46 
 
 		 159 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  50.31 
 
 		 159 aa  177  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  52.83 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  54.72 
 
 		 159 aa  170  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 167 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 		 159 aa  167  7e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  47.17 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  44.38 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  46.54 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  47.17 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  47.47 
 
 		 159 aa  146  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  45.91 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  40.88 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  41.51 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  48.99 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  41.51 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  44.03 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  39.87 
 
 		 153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  37.97 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  42.41 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  40.25 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  42.14 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  40.25 
 
 		 157 aa  126  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  41.77 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  41.88 
 
 		 154 aa  124  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  40.51 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  38.36 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  37.11 
 
 		 159 aa  121  5e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  42.41 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  42.41 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  41.14 
 
 		 152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  34.59 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  37.74 
 
 		 153 aa  117  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  44.65 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  39.75 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  41.88 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  37.97 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  36.48 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  36.88 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  39.51 
 
 		 160 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  37.11 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  39.51 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  38.18 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  33.96 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  40.51 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  36.71 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  39.24 
 
 		 144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  39.87 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  34.55 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  35.22 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  34.42 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>