289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3775 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  100 
 
 		 154 aa  317  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  98.05 
 
 		 154 aa  308  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  73.2 
 
 		 153 aa  246  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  70.59 
 
 		 154 aa  232  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  69.28 
 
 		 153 aa  213  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  64.71 
 
 		 152 aa  191  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  56.21 
 
 		 153 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  43.87 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  38.61 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  44.23 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  39.35 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  39.49 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  35.03 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  40.65 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  40.13 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  37.34 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  34.81 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  36.42 
 
 		 160 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  38.82 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  37.66 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  38.61 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  38.75 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  35.67 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  38.06 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000163704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000336055  unclonable  0.0000000000393257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  33.95 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  35.67 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000256643  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  36.84 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  40.26 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3316  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  36.71 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  35.29 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  36.94 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000535521  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  34.39 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000116859  decreased coverage  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  31.21 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  34.81 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000354968  normal  0.0933085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>