289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1037 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  100 
 
 
154 aa  297  4e-80  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  58.06 
 
 
155 aa  172  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  40.99 
 
 
160 aa  134  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 
159 aa  134  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  47.5 
 
 
159 aa  133  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 
159 aa  131  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  132  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  43.83 
 
 
159 aa  130  5e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  46.25 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  38.12 
 
 
160 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  43.48 
 
 
160 aa  127  8.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  42.33 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  46.25 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  43.12 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  42.5 
 
 
159 aa  123  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  43.75 
 
 
159 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  44.03 
 
 
159 aa  122  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
167 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  43.67 
 
 
167 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  41.25 
 
 
159 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  43.12 
 
 
159 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 
159 aa  121  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  44.38 
 
 
159 aa  120  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  120  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 
159 aa  120  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 
159 aa  120  8e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  42.5 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  40.72 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  41.61 
 
 
160 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  43.75 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  36.88 
 
 
159 aa  116  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  37.58 
 
 
165 aa  113  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  32.5 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  31.41 
 
 
156 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  35.48 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  41.94 
 
 
155 aa  110  8.000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  38.36 
 
 
158 aa  108  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  33.99 
 
 
153 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 
156 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  47.44 
 
 
154 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  31.87 
 
 
162 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  38.51 
 
 
160 aa  104  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 
155 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  38.85 
 
 
150 aa  105  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  33.99 
 
 
154 aa  104  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 
154 aa  104  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf790  hypothetical protein  41.83 
 
 
143 aa  103  6e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 
154 aa  103  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  28.85 
 
 
156 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  39.35 
 
 
155 aa  102  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  33.77 
 
 
145 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  30.86 
 
 
166 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  27.56 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  33.75 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  38.22 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  27.56 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  28.85 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  28.85 
 
 
157 aa  97.4  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  26.92 
 
 
155 aa  97.1  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  26.92 
 
 
155 aa  97.1  9e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  27.56 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  35.53 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  27.74 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  27.74 
 
 
156 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  36.71 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  38.26 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  28.57 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  25.79 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  26.28 
 
 
156 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  30.63 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  26.92 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  27.56 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  28.75 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  27.56 
 
 
156 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  25.81 
 
 
156 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  29.22 
 
 
153 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  26.92 
 
 
155 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  27.27 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  26.28 
 
 
156 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  26.28 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  33.97 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  26.28 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  27.1 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  25.81 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>