288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2788 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 155 aa  323  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  56.41 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  53.21 
 
 		 157 aa  175  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  53.21 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  52.56 
 
 		 157 aa  163  9e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  50 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  47.44 
 
 		 157 aa  154  4e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  40 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  42.58 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  40 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  43.59 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  39.35 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  36.77 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  38.06 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  37.34 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  35.06 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  33.77 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  33.77 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  39.74 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  34.42 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 167 aa  110  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  37.65 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  37.97 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  34.84 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  34.84 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  35.03 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  38.46 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1654  hypothetical protein  37.58 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  34.18 
 
 		 159 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  35.25 
 
 		 194 aa  97.4  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  31.85 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  32.68 
 
 		 155 aa  97.1  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  32.67 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  34.38 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  33.57 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  30.38 
 
 		 155 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 155 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  32.05 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  29.41 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  34.44 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 155 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  33.12 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  33.55 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  32.05 
 
 		 177 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  32.69 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  30.07 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  31.21 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  30.57 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  31.17 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  33.54 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  30.13 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1716  rRNA large subunit methyltransferase  31.21 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  37.11 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  29.11 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>