289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0027 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 159 aa  323  8.000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  75.47 
 
 		 159 aa  245  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  67.3 
 
 		 159 aa  215  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  66.04 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  65.41 
 
 		 159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  64.78 
 
 		 159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  64.78 
 
 		 167 aa  209  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  64.78 
 
 		 167 aa  209  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  63.52 
 
 		 159 aa  206  7e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  62.89 
 
 		 159 aa  203  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 		 159 aa  187  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 		 159 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 		 159 aa  184  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 		 159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 		 159 aa  181  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  56.88 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  54.72 
 
 		 160 aa  178  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 		 159 aa  173  9e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 		 159 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  49.69 
 
 		 159 aa  159  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  48.73 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  49.06 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  47.8 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  44.03 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  48.43 
 
 		 165 aa  140  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  49.69 
 
 		 156 aa  140  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  50.97 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  45.91 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  47.17 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  40.88 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  43.4 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  42.77 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  42.77 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  38.99 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  41.51 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  41.51 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  42.5 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  39.62 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  44.59 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  37.65 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 155 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  38.12 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  39.24 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  38.36 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 		 155 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  35.85 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  33.96 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  36.02 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  34.81 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  37.97 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  37.65 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  41.88 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  40.38 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  36.71 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  34.59 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000336055  unclonable  0.0000000000393257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  35.22 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  37.82 
 
 		 154 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  35.44 
 
 		 154 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>