289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2927 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
159 aa  324  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
159 aa  324  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  67.3 
 
 
159 aa  221  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  63.52 
 
 
159 aa  208  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  62.89 
 
 
159 aa  208  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
159 aa  207  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
159 aa  207  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
159 aa  207  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
159 aa  207  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
159 aa  207  6e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
159 aa  206  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  205  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
167 aa  205  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
167 aa  205  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
159 aa  202  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  59.12 
 
 
159 aa  201  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 
159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 
177 aa  197  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  197  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 
159 aa  194  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  191  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 
159 aa  190  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  187  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
160 aa  184  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  183  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  53.46 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 
159 aa  177  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 
159 aa  174  6e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  50.94 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  52.5 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  48.43 
 
 
159 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 
159 aa  164  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  50.31 
 
 
160 aa  164  5e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  46.54 
 
 
159 aa  158  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  46.54 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  45.28 
 
 
160 aa  153  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  83.33 
 
 
84 aa  151  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  40.25 
 
 
160 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  46.84 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  45.28 
 
 
156 aa  143  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  44.94 
 
 
157 aa  136  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  39.62 
 
 
159 aa  136  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  43.4 
 
 
165 aa  135  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  51.01 
 
 
155 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  41.77 
 
 
157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  47.5 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  38.36 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  39.62 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  40.51 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  36.48 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  38.12 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  38.12 
 
 
153 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  41.14 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  44.03 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 
155 aa  124  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  36.81 
 
 
153 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  47.8 
 
 
154 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  37.97 
 
 
157 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  41.36 
 
 
150 aa  121  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  35.85 
 
 
159 aa  121  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  38.51 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  35.44 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  38.85 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  40.51 
 
 
153 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
166 aa  114  5e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  35.44 
 
 
153 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  35.17 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  39.24 
 
 
152 aa  110  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf790  hypothetical protein  42.14 
 
 
143 aa  110  6e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  34.18 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  33.96 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0119  protein of unknown function DUF163  35.8 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  39.75 
 
 
155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  36.81 
 
 
160 aa  107  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  31.87 
 
 
156 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  32.28 
 
 
154 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  30.82 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  34.59 
 
 
156 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  35.85 
 
 
155 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  32.28 
 
 
154 aa  106  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  34.81 
 
 
152 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 
156 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
155 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  30.82 
 
 
155 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  32.08 
 
 
156 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  31.21 
 
 
156 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1093  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000256643  hitchhiker  0.000000000516486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000535521  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>