289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2576 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  43.87 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  40.51 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  43.23 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  43.4 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  41.29 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  42.58 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  44.52 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  41.29 
 
 		 153 aa  124  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  44.52 
 
 		 152 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  40.38 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  42.14 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  42.68 
 
 		 155 aa  120  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  38.22 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  40.76 
 
 		 177 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  41.77 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  38.99 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  36.71 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  40.91 
 
 		 145 aa  114  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  38.22 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  40.79 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  39.49 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  38.71 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  36.25 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  42.41 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  35.48 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  37.33 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  38.06 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  36.08 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  38.31 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  38.31 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  35.71 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  41.77 
 
 		 162 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  36.77 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  36.77 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  41.29 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  38.12 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  39.74 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  40 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  35.44 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 157 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>