289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19420 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  316  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  62.82 
 
 		 165 aa  203  9e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  54.49 
 
 		 150 aa  169  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  154  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  50.31 
 
 		 160 aa  153  8e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  52.2 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 		 167 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 		 167 aa  150  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  49.68 
 
 		 177 aa  149  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  46.54 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  45 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  46.58 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  46.54 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  45.68 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  47.8 
 
 		 159 aa  140  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  44.65 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  40.88 
 
 		 160 aa  134  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  42.41 
 
 		 159 aa  133  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  44.23 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  40 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  42.31 
 
 		 153 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  42.31 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  41.03 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  40.13 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  38.71 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  40.38 
 
 		 153 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  38.71 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  42.21 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  37.89 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  43.79 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  39.49 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  37.82 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  35.67 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  35.4 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  40.38 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  34.19 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  39.87 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  37.11 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  34.19 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  32.7 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  37.25 
 
 		 155 aa  103  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  33.95 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  39.47 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  37.04 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  36.54 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0119  protein of unknown function DUF163  36.31 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  34.62 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  32.69 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  30.77 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  32.05 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  28.85 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  32.05 
 
 		 155 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  35.22 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>