289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0677 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  320  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  50.31 
 
 
159 aa  158  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  48.43 
 
 
159 aa  147  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
159 aa  147  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  46.54 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 
177 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
160 aa  140  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  42.77 
 
 
160 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  41.88 
 
 
160 aa  135  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  44.03 
 
 
160 aa  135  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 
159 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
167 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
167 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
159 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  44.65 
 
 
159 aa  133  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 
159 aa  130  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  42.77 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  42.14 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  39.49 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  39.49 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  40.51 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  41.77 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  43.31 
 
 
152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  39.62 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  38.36 
 
 
159 aa  112  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
159 aa  112  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  35.8 
 
 
162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 
157 aa  111  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  37.11 
 
 
160 aa  110  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  32.28 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  38.36 
 
 
153 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 
156 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  38.36 
 
 
154 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  38.61 
 
 
153 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  42.28 
 
 
155 aa  108  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  36.08 
 
 
156 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  33.95 
 
 
166 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
156 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 
157 aa  107  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  33.54 
 
 
155 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  39.24 
 
 
157 aa  107  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
156 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 
155 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  35.44 
 
 
154 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  37.11 
 
 
159 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 
156 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 
157 aa  105  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
156 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000132782  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1136  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 
156 aa  104  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00404994  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2563  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
157 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2950  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
157 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  34.57 
 
 
162 aa  103  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 
155 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  30.38 
 
 
156 aa  103  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 
153 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 
155 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  37.04 
 
 
156 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 
155 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 
155 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  41.03 
 
 
154 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  35.85 
 
 
153 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  29.75 
 
 
156 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000227435  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
155 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 
155 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  30.38 
 
 
156 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  36.48 
 
 
145 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1716  rRNA large subunit methyltransferase  29.75 
 
 
156 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962175  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 
156 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 
156 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 
156 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  27.85 
 
 
156 aa  101  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 
156 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 
156 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  36.71 
 
 
153 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  29.75 
 
 
156 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 
155 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>