289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0070 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  75.47 
 
 
159 aa  245  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  63.52 
 
 
159 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  64.15 
 
 
159 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  62.89 
 
 
159 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  62.89 
 
 
159 aa  209  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  62.89 
 
 
159 aa  209  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  62.89 
 
 
159 aa  209  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  62.89 
 
 
159 aa  209  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  62.89 
 
 
159 aa  208  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
159 aa  208  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
167 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  62.26 
 
 
167 aa  207  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  202  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  62.26 
 
 
159 aa  201  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 
159 aa  196  9e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 
159 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
177 aa  186  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  52.83 
 
 
160 aa  181  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
159 aa  177  5.999999999999999e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  175  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 
159 aa  174  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 
159 aa  174  6e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  55 
 
 
160 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  52.83 
 
 
159 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 
159 aa  167  7e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  166  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  155  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
159 aa  154  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  47.17 
 
 
159 aa  154  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 
159 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  45.91 
 
 
159 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  46.2 
 
 
159 aa  147  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  42.77 
 
 
160 aa  146  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  47.17 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  45.68 
 
 
156 aa  141  4e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  42.77 
 
 
159 aa  140  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  44.44 
 
 
165 aa  138  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  39.62 
 
 
150 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  40.62 
 
 
154 aa  121  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  44.97 
 
 
155 aa  120  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  32.7 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  38.75 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  35.22 
 
 
159 aa  114  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  37.74 
 
 
153 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  35.44 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  43.31 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  38.36 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  38.99 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  36.48 
 
 
158 aa  112  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 
153 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  36.48 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  36.48 
 
 
153 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
166 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  36.42 
 
 
155 aa  105  3e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 
162 aa  102  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  39.24 
 
 
157 aa  101  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  36.48 
 
 
155 aa  101  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  34.81 
 
 
157 aa  100  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
162 aa  100  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  33.95 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 
154 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  38.46 
 
 
154 aa  99  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  31.45 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  33.97 
 
 
157 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
155 aa  97.4  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  32.91 
 
 
157 aa  97.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 
155 aa  97.1  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  30.63 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  31.18 
 
 
160 aa  95.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  31.01 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
155 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  38.51 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  36.31 
 
 
155 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  28.75 
 
 
155 aa  94  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  34.52 
 
 
160 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
155 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  30.38 
 
 
154 aa  94  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  28.3 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  29.56 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  28.3 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  30.63 
 
 
155 aa  92.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  31.65 
 
 
154 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  52.44 
 
 
84 aa  92  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  37.18 
 
 
158 aa  91.7  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  28.3 
 
 
155 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  34.73 
 
 
156 aa  91.3  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>