289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0291 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  100 
 
 
160 aa  321  3e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  58.13 
 
 
159 aa  184  6e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  56.88 
 
 
159 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  54.37 
 
 
159 aa  180  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  54.37 
 
 
159 aa  180  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  56.88 
 
 
159 aa  179  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  52.5 
 
 
159 aa  174  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  55 
 
 
159 aa  173  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  55 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  52.5 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  52.5 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  53.75 
 
 
159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  54.37 
 
 
159 aa  169  1e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  164  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  55 
 
 
177 aa  164  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  53.75 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  51.85 
 
 
159 aa  157  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  157  5e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 
159 aa  157  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  47.5 
 
 
160 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  46.25 
 
 
159 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  45 
 
 
159 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  152  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  44.38 
 
 
159 aa  149  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  46.25 
 
 
159 aa  148  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  45.28 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  46.58 
 
 
156 aa  142  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  45 
 
 
160 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  53.33 
 
 
155 aa  140  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  45 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  41.88 
 
 
158 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  41.88 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  41.88 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  40.62 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  42.68 
 
 
159 aa  124  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  39.38 
 
 
153 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  40.88 
 
 
157 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
157 aa  123  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  41.88 
 
 
159 aa  123  1e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  36.88 
 
 
155 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  36.88 
 
 
145 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  120  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  38.75 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  38.65 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  39.38 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  38.75 
 
 
153 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  40.51 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  35.4 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 
155 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  37.42 
 
 
160 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  37.2 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
156 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  32.5 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 
155 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 
155 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  37.89 
 
 
155 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 
157 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  31.25 
 
 
155 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 
160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  35.8 
 
 
162 aa  107  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 
157 aa  107  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 
156 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  34.94 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  36.42 
 
 
154 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  31.25 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  36.59 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  37.04 
 
 
155 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  36.42 
 
 
154 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  30.63 
 
 
155 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  34.57 
 
 
153 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  34.34 
 
 
160 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  33.12 
 
 
155 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 
155 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  34.38 
 
 
156 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 
156 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  38.51 
 
 
154 aa  104  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.4 
 
 
156 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  36.69 
 
 
145 aa  104  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 
156 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>