289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0073 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  100 
 
 
159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  55.35 
 
 
159 aa  184  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  56.6 
 
 
177 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  52.2 
 
 
159 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 
159 aa  170  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  167  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  50.94 
 
 
160 aa  167  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 
159 aa  167  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 
159 aa  162  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  48.43 
 
 
159 aa  161  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 
160 aa  160  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 
159 aa  160  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  51.57 
 
 
160 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  50.62 
 
 
159 aa  156  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  50 
 
 
159 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 
159 aa  154  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  45 
 
 
160 aa  153  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
159 aa  151  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
159 aa  149  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  45.28 
 
 
159 aa  147  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  46.54 
 
 
156 aa  142  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 
159 aa  143  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  44.65 
 
 
160 aa  142  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  42.14 
 
 
165 aa  140  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 
159 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  40.25 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  38.99 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  39.62 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  41.51 
 
 
145 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  42.14 
 
 
158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  38.36 
 
 
159 aa  120  8e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  42.41 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  43.75 
 
 
154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  38.36 
 
 
159 aa  117  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  36.71 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  37.97 
 
 
154 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  38.27 
 
 
150 aa  114  6e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  37.74 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  38.61 
 
 
153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  41.61 
 
 
155 aa  110  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  33.54 
 
 
156 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  51.19 
 
 
84 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  39.24 
 
 
154 aa  105  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  35.26 
 
 
155 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  40 
 
 
155 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  41.51 
 
 
154 aa  105  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  41.51 
 
 
158 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
156 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 
162 aa  105  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  34.81 
 
 
157 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 
154 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  38.75 
 
 
157 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
157 aa  102  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  34.59 
 
 
155 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  34.16 
 
 
166 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  35.22 
 
 
153 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 
157 aa  100  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  35.22 
 
 
155 aa  100  6e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  100  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  35.85 
 
 
153 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  32.73 
 
 
170 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 
162 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 
160 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  33.94 
 
 
160 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  34.76 
 
 
156 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0083  hypothetical protein  38.61 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000837778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  38.61 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  34.52 
 
 
160 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>