289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2599 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2599  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  176  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  83.33 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  83.33 
 
 		 159 aa  151  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  58.33 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  57.14 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  61.9 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  57.14 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  59.52 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  55.95 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  54.76 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  54.76 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  58.33 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  58.33 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  58.33 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  58.33 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  58.33 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  58.33 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  58.33 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  51.19 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  57.14 
 
 		 159 aa  105  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  53.66 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  57.14 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  57.14 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  54.76 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  53.57 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  53.57 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 		 159 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  53.57 
 
 		 159 aa  98.6  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  53.57 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  51.76 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  48.81 
 
 		 159 aa  95.9  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  48.81 
 
 		 159 aa  95.9  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  52.38 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  46.43 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  52.38 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  48.81 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  51.81 
 
 		 159 aa  93.6  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  47.62 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  52.44 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl478  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  44.05 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  47.62 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  47.56 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  48.81 
 
 		 158 aa  87.8  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  45.78 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  39.29 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  46.99 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  45.24 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  44.05 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  40.48 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  44.58 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf790  hypothetical protein  48.81 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  44.58 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  40.48 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  38.1 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  40.96 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  42.17 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  39.29 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  47.62 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  40.48 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  40.48 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  40.96 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0185  hypothetical protein  44.58 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1654  hypothetical protein  44.58 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  45.78 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  40.48 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  40.74 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  42.17 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  40.48 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  36.9 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0213  conserved hypothetical protein (DUF163 domain protein)  45.24 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  38.55 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  40.48 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  39.76 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  39.29 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  39.76 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  34.52 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  43.37 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  39.76 
 
 		 170 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  42.17 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0119  protein of unknown function DUF163  40.7 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  42.17 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0121  hypothetical protein  41.67 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.257254  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  34.52 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0139  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.500957  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0161  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.366222  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  36.14 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1331  rRNA large subunit methyltransferase  42.35 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  42.35 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  42.68 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0548  hypothetical protein  40.48 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  33.71 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  38.55 
 
 		 155 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  36.9 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  36.9 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>