289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3770 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  42.68 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  43.95 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  41.4 
 
 		 157 aa  136  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  39.49 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  37.58 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  38.61 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  35.26 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  36.31 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  37.97 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  36.25 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  37.97 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  34.18 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  37.34 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  38.61 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  35.48 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  34.62 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  37.5 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  36.13 
 
 		 154 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  34.81 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  33.76 
 
 		 154 aa  104  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  31.85 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  36.08 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  36.25 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  34.39 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  36.13 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  36.54 
 
 		 155 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  37.33 
 
 		 148 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 177 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  31.21 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  34.44 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  34.81 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  35.22 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  100  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  37.34 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  35.26 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  36.13 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  39.38 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  38.22 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  34.62 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  33.55 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  36.36 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  32.69 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0856  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000031317  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  34.19 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  33.97 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  34.19 
 
 		 153 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  38.03 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  31.65 
 
 		 160 aa  94.4  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  35.48 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>