288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1082 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  100 
 
 		 152 aa  296  5e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  54.97 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  51.32 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  52.63 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  48.39 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  49.03 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 		 160 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  45.75 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  43.21 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  44.44 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  46.79 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  46.75 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  46.45 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  42.04 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  44.81 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1807  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  35.44 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  42.48 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  42.48 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  43.14 
 
 		 156 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  39.74 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  41.72 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  43.23 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  43.59 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  41.06 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  41.18 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  42.41 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  42.58 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  43.51 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  36.71 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  43.31 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  41.18 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  44.2 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  42.86 
 
 		 155 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 170 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  41.18 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  42.86 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  44.2 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  42.86 
 
 		 155 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  44.93 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  42.33 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1561  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  44.2 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  44.2 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  44.2 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  44.2 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  42.21 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  43.23 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  39.1 
 
 		 157 aa  97.1  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2963  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1202  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  41.29 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  42.34 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  39.61 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  41.72 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  36.36 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  40.38 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 155 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  42.76 
 
 		 153 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  41.14 
 
 		 162 aa  94.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  37.25 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  41.4 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  42.38 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  37.01 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  34.81 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  38.96 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  41.72 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1136  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00404994  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  38.24 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  41.56 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  38.96 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  39.35 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  40.91 
 
 		 155 aa  94  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>