289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1641 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  293  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2319  hypothetical protein  40.69 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1137  protein of unknown function DUF163  43.54 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240121  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  40.38 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  39.47 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  39.47 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  38.82 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  39.22 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  39.1 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  40.25 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 160 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  40.13 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  37.66 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1236  protein of unknown function DUF163  36.55 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0319909  normal  0.195697 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  98.2  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  39.47 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  32.91 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  41.67 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  36.48 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0322  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.072258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000047133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000239477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000108281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  33.13 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121913  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  34.84 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  30.19 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  34.19 
 
 		 155 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0390  rRNA large subunit methyltransferase  33.13 
 
 		 162 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.509828  normal  0.0157445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  35.9 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  34.59 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  39.1 
 
 		 155 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 156 aa  89.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  38.16 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  30.52 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 177 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  35.26 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  30.32 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  35.22 
 
 		 158 aa  88.2  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000354968  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 156 aa  88.2  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000490967  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  39.35 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000270066  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  50.54 
 
 		 174 aa  88.2  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  34.62 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  50.54 
 
 		 169 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  36.54 
 
 		 155 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1327  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2868  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000163704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01658  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000106355  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>