289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1840 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 174 aa  345  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  95.98 
 
 		 169 aa  327  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  87.36 
 
 		 160 aa  297  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  59.54 
 
 		 160 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  58.05 
 
 		 160 aa  204  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  57.8 
 
 		 160 aa  203  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  53.45 
 
 		 160 aa  194  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  55.17 
 
 		 159 aa  188  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  50.87 
 
 		 160 aa  178  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  48.28 
 
 		 160 aa  151  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  47.98 
 
 		 160 aa  148  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  49.43 
 
 		 160 aa  147  9e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  49.43 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  48.28 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  46.82 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  48.28 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  47.4 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  46.24 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  46.24 
 
 		 155 aa  141  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  47.7 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  41.95 
 
 		 170 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  44.25 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  44.51 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  43.35 
 
 		 156 aa  134  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  43.35 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  40.46 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  44.51 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  43.93 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  42.53 
 
 		 156 aa  127  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  45.4 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  41.38 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  41.38 
 
 		 165 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  40.23 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  41.04 
 
 		 141 aa  117  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  44.83 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  41.04 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  42.53 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  38.71 
 
 		 137 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  36.99 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  35.06 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  30.64 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  36.78 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  30.06 
 
 		 159 aa  97.4  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  36.57 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  29.65 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  36 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  36.78 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  36 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  36 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  36.42 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  35.43 
 
 		 156 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  36 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 156 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  38.86 
 
 		 156 aa  94  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  34.88 
 
 		 146 aa  94.4  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  35.43 
 
 		 156 aa  94  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  33.14 
 
 		 157 aa  94  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  38.15 
 
 		 158 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  37.71 
 
 		 155 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  35.06 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  49.45 
 
 		 153 aa  91.3  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  37.79 
 
 		 152 aa  90.9  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  36 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  31.03 
 
 		 160 aa  89  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  36.72 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  34.66 
 
 		 159 aa  88.6  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  31.98 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  35.43 
 
 		 156 aa  87.8  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  50.54 
 
 		 148 aa  88.2  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  34.48 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  35.23 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  31.82 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  34.3 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  34.66 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  39.43 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  35.06 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  33.14 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  42.61 
 
 		 135 aa  85.1  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  30.46 
 
 		 156 aa  84.3  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  47.19 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  29.48 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  35.39 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  33.9 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34446  predicted protein  33.99 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.693948  normal  0.0400957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  46.15 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  42.61 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  30.81 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  38.4 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  36.21 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>