288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0576 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  67.14 
 
 		 140 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  65.96 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  44.23 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  42.58 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  41.94 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  39.13 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  41.03 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  42.58 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  44.74 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  42.14 
 
 		 185 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 159 aa  106  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  36.99 
 
 		 174 aa  105  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 		 160 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 162 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 		 162 aa  103  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  38.71 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  37.11 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 		 154 aa  97.1  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 		 160 aa  96.3  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  45.83 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  50 
 
 		 153 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  37.5 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  46.39 
 
 		 173 aa  87  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  43.08 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 		 170 aa  86.3  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  49.41 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  45.88 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  39.39 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  35.58 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  47.25 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  43.33 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  36.2 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  44.94 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  44.21 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  43.62 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  46.15 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  43.62 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  43.62 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1236  protein of unknown function DUF163  34.51 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0319909  normal  0.195697 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  44.21 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  41.49 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  42.86 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  38.78 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  42.16 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  42.86 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  42.42 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  33.99 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  31.41 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  39.36 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  28.12 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0864  hypothetical protein  39.29 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0226584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  32.47 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  31.82 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  42.86 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  32.35 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  35.17 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  41.76 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  31.17 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  40.43 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  41.18 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  26.11 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  28.48 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  36.43 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  35.06 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2080  rRNA large subunit methyltransferase  42 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  34.21 
 
 		 155 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  42.55 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  39.29 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  39.56 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  33.12 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  42.11 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3822  rRNA large subunit methyltransferase  38.89 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  34.92 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.290854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>