289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3453 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 159 aa  317  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  59.75 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  55.17 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  56.21 
 
 		 169 aa  187  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  57.23 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 160 aa  170  5.999999999999999e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  53.12 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  52.2 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  143  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  47.17 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  49.69 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  47.47 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  48.43 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  50.31 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  45.62 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  45.62 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  49.06 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  48.1 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  47.47 
 
 		 155 aa  130  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  43.56 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  45.57 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  45.62 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  41.51 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  40.88 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  38.99 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  42.5 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0576  hypothetical protein  38.99 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.262239 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  42.14 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  38.36 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  32.28 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.42 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  38.22 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  39.68 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  36.65 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  31.25 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  37.11 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3345  hypothetical protein  36.88 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0130226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  38.22 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  34.39 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  34.57 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  47.06 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  36.02 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  34.97 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  38.85 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  33.96 
 
 		 155 aa  88.6  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  30.63 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  32.61 
 
 		 145 aa  87.8  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  38.24 
 
 		 135 aa  87.4  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2624  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0866518  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  37.68 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  36 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  39.6 
 
 		 155 aa  85.5  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  36.65 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  36.97 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  32.32 
 
 		 159 aa  84  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  39.51 
 
 		 152 aa  84  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  34.78 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  44.57 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1948  rRNA large subunit methyltransferase  34.55 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  32.5 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  42.16 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  33.74 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_002950  PG2087  rRNA large subunit methyltransferase  31.25 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  42.86 
 
 		 173 aa  82.8  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  34.97 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  34.36 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  34.97 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  43.14 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1884  rRNA large subunit methyltransferase  42.16 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.616736  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  34.97 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  34.81 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>