288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2564 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2564  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 165 aa  319  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528144 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2289  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 		 165 aa  319  8e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.080755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2246  rRNA large subunit methyltransferase  94.55 
 
 		 165 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.37412  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0100  rRNA large subunit methyltransferase  63.58 
 
 		 164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.465557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4221  rRNA large subunit methyltransferase  66.87 
 
 		 162 aa  207  8e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.0594421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4731  rRNA large subunit methyltransferase  63.19 
 
 		 162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0416  rRNA large subunit methyltransferase  58.13 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.852231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  58.39 
 
 		 160 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  50 
 
 		 160 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  55.28 
 
 		 160 aa  153  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  56.25 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  56.25 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2933  rRNA large subunit methyltransferase  49.38 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1475  hypothetical protein  47.5 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.710814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2061  rRNA large subunit methyltransferase  55 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0568  rRNA large subunit methyltransferase  55.62 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0162  rRNA large subunit methyltransferase  53.75 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  46.88 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3453  rRNA large subunit methyltransferase  45.62 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1059  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  48.75 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  43.75 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1840  rRNA large subunit methyltransferase  43.68 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1773  rRNA large subunit methyltransferase  44.38 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  43.75 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2794  hypothetical protein  42.5 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  45 
 
 		 155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  47.83 
 
 		 155 aa  117  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  41.88 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  44.38 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2505  rRNA large subunit methyltransferase  38.75 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1235  hypothetical protein  46.25 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4722  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  42.33 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  41.72 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  41.1 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  39.88 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2659  hypothetical protein  35.58 
 
 		 157 aa  99.8  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0267321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  39.26 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  32.34 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  32.34 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  42.24 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  39.26 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  39.26 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  39.26 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  39.26 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  43.03 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  34.38 
 
 		 156 aa  97.4  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  44 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2545  hypothetical protein  40.12 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146464  normal  0.474294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  31.06 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  44.76 
 
 		 135 aa  94.4  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  31.68 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  48.08 
 
 		 156 aa  94  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  36.2 
 
 		 155 aa  94  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  29.34 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  32.53 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  32.3 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  32.92 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  32.92 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  38.65 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  38.65 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  38.79 
 
 		 165 aa  91.7  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  28.57 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  34.73 
 
 		 160 aa  92  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  44.23 
 
 		 147 aa  91.3  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  39.87 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  38.89 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  38.12 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  38.3 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  33.13 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  37.8 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  29.81 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  36.88 
 
 		 156 aa  88.2  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  38.58 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  29.7 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0378  hypothetical protein  40.58 
 
 		 137 aa  87.4  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  35.19 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  31.06 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0057  hypothetical protein  36.88 
 
 		 141 aa  87.4  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  36.2 
 
 		 156 aa  87.4  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  37.2 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  41.25 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  31.68 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.98 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  30.82 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>