289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09251 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  97.1 
 
 		 138 aa  241  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0864  hypothetical protein  94.2 
 
 		 138 aa  235  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0226584  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10181  hypothetical protein  81.16 
 
 		 137 aa  213  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  129  9e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  41.13 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  40.15 
 
 		 150 aa  120  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  43.75 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  42.74 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.06 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  37.66 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  31.61 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  37.75 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  32.9 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  34.81 
 
 		 159 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  30.32 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  35.06 
 
 		 156 aa  93.6  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  32.26 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  32.47 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 167 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  34.42 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  37.58 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  30.52 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  33.55 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  35.53 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  35.03 
 
 		 159 aa  90.5  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2527  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 159 aa  89.4  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  33.97 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  29.22 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  30.46 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  34.27 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  32.48 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  29.56 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  33.74 
 
 		 160 aa  87.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  33.1 
 
 		 147 aa  87.8  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  31.82 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  34.21 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  31.87 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  34.25 
 
 		 148 aa  87  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  32.05 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  28.57 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3342  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000127948  normal  0.0166889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  31.17 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  32.28 
 
 		 173 aa  85.5  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  29.41 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  28.76 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 177 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1764  rRNA large subunit methyltransferase  31.25 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1512  rRNA large subunit methyltransferase  32.69 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000386318  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  35.67 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  31.79 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  32.09 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  36.08 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  31.45 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4826  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715352  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4366  rRNA large subunit methyltransferase  27.27 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712545  normal  0.959916 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0256  rRNA large subunit methyltransferase  28.3 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  35.03 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  26.62 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  31.75 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  32.91 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  27.27 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1733  rRNA large subunit methyltransferase  32.03 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  31.79 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  31.85 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  26.62 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  31.79 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  26.62 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  26.62 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  33.12 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  32.03 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>