289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0276 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0276  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  306  4e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.219326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  97.93 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  51.75 
 
 		 144 aa  168  2e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  55.56 
 
 		 145 aa  167  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  49.65 
 
 		 144 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  51.03 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09251  hypothetical protein  45.14 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09231  hypothetical protein  43.75 
 
 		 138 aa  117  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0123975  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10181  hypothetical protein  46.53 
 
 		 137 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0864  hypothetical protein  43.75 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0226584  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  43.36 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  41.03 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  40.67 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  39.35 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  39.07 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  37.75 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  39.31 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  37.75 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  37.75 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  37.25 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  40 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  36.18 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  35.57 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  35.95 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1242  rRNA large subunit methyltransferase  41.43 
 
 		 135 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  38 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3199  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0492492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2688  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 		 155 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169878  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  34.21 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 159 aa  97.4  6e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  37.91 
 
 		 173 aa  97.1  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  38.06 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1342  rRNA large subunit methyltransferase  34.21 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  38.93 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  36.36 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  37.97 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  36.42 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  38.27 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2126  protein of unknown function DUF163  34.87 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.933959  normal  0.0354668 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  37.75 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1707  rRNA large subunit methyltransferase  35.1 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  40.27 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  33.55 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000142803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  33.55 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1902  rRNA large subunit methyltransferase  34.44 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0816634  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  36.08 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  33.14 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  35.81 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  35.53 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  35.37 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  36.9 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  36.9 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  34.44 
 
 		 155 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  36.69 
 
 		 177 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  37.65 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  37.04 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  36.67 
 
 		 155 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0362  hypothetical protein  35.95 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1973  rRNA large subunit methyltransferase  35.76 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3525  rRNA large subunit methyltransferase  33.77 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144296  normal  0.0487834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  35.92 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  38.31 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>