289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0119 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0119  protein of unknown function DUF163  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  40.76 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  35.8 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  35.8 
 
 		 159 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  37.91 
 
 		 154 aa  105  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  36.31 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  34.84 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  37.25 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  36.25 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  37.5 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 		 167 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  36.88 
 
 		 167 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  36.65 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  36.88 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  41.67 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  32.52 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  39.74 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  33.55 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  29.38 
 
 		 160 aa  94.7  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  36.59 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  39.1 
 
 		 153 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  38.46 
 
 		 153 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  35.62 
 
 		 159 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  35 
 
 		 160 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3612  hypothetical protein  33.99 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000547821  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0613  rRNA large subunit methyltransferase  30.67 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  35.62 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  33.75 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  35.62 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0486  hypothetical protein  34.72 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000178654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0780  rRNA large subunit methyltransferase  30.63 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329962  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0024  hypothetical protein  37.5 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.820161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3630  protein of unknown function DUF163  34.64 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000133759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3208  hypothetical protein  33.99 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0200038  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  39.51 
 
 		 159 aa  88.6  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  34.39 
 
 		 156 aa  88.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  30.07 
 
 		 152 aa  88.6  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  30 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  31.48 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0322  rRNA large subunit methyltransferase  38.12 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  33.12 
 
 		 159 aa  88.2  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2517  rRNA large subunit methyltransferase  39.87 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.148651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  30 
 
 		 159 aa  87  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  30.63 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  32.5 
 
 		 159 aa  86.7  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2273  SPOUT methyltransferase superfamily protein  33.54 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.246773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0088  rRNA large subunit methyltransferase  39.49 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0114414  normal  0.53865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3014  rRNA large subunit methyltransferase  40 
 
 		 160 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0634983  normal  0.903693 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  30.63 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  39.13 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0155  rRNA large subunit methyltransferase  42.04 
 
 		 155 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  32.91 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  38.51 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  31.41 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0647  rRNA large subunit methyltransferase  36.81 
 
 		 160 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0130752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 156 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  33.33 
 
 		 157 aa  84  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  32.28 
 
 		 156 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  31.65 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  31.01 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1738  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0866  rRNA large subunit methyltransferase  40.13 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  31.87 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  33.95 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  33.75 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0164  rRNA large subunit methyltransferase  46.32 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  29.68 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  29.38 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1641  hypothetical protein  37.67 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.230899  normal  0.661833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0377  rRNA large subunit methyltransferase  33.54 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2526  rRNA large subunit methyltransferase  39.49 
 
 		 155 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.631198  normal  0.935869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>