More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0109 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
119 aa  243  6.999999999999999e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  67.26 
 
 
197 aa  167  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  60.34 
 
 
186 aa  162  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  62.73 
 
 
175 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 
192 aa  135  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  54.87 
 
 
188 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  53.1 
 
 
204 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  54.87 
 
 
191 aa  134  5e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  51.33 
 
 
183 aa  123  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  50.44 
 
 
146 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 
86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 
90 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  57.32 
 
 
139 aa  107  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 
90 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  58.54 
 
 
88 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 
90 aa  105  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
90 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
90 aa  103  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 
91 aa  103  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  57.14 
 
 
96 aa  102  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  59.26 
 
 
82 aa  101  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  54.65 
 
 
90 aa  101  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 
90 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 
88 aa  101  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 
90 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 
85 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  41.44 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  42.86 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  42.34 
 
 
195 aa  97.4  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  56.1 
 
 
96 aa  97.1  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 
81 aa  95.5  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  55 
 
 
81 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  44.79 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  60.81 
 
 
81 aa  95.9  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  47.62 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 
87 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  38.74 
 
 
135 aa  94.4  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  52.44 
 
 
82 aa  94.7  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  55 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  56.63 
 
 
91 aa  94.4  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  44.79 
 
 
136 aa  94  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 
95 aa  93.6  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  48.81 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1028  ribosomal protein S16  56.98 
 
 
208 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  47.56 
 
 
88 aa  92  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  38.74 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  51.25 
 
 
85 aa  91.7  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  55.26 
 
 
81 aa  90.9  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  53.16 
 
 
84 aa  90.5  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 
91 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  52.56 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  52.56 
 
 
86 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  54.05 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  51.25 
 
 
82 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
86 aa  89  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  47.56 
 
 
90 aa  87.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  50.53 
 
 
122 aa  87.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 
154 aa  87.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 
81 aa  87.4  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 
81 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 
81 aa  86.7  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  50 
 
 
201 aa  86.3  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  47.5 
 
 
81 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
120 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  48.75 
 
 
92 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  50.6 
 
 
89 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 
120 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  47 
 
 
119 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 
120 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 
134 aa  83.6  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  48.24 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  49.35 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 
121 aa  83.2  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 
107 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 
119 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  46.15 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 
81 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  50 
 
 
106 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  48.78 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  41.35 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>