More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1805 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 95 aa  190  7e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  70.79 
 
 		 90 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  71.74 
 
 		 95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  71.74 
 
 		 95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  59.78 
 
 		 111 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  55.81 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  53.26 
 
 		 96 aa  107  7.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  56.25 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  55.06 
 
 		 91 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 87 aa  100  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  51.76 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 85 aa  98.2  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 81 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 89 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  51.14 
 
 		 90 aa  96.7  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  55 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 86 aa  95.5  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  51.14 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 81 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 88 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  53.75 
 
 		 85 aa  92.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 83 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  47.19 
 
 		 91 aa  92  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  48.35 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  46.59 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  46.59 
 
 		 90 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 81 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 86 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 183 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 191 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  43.48 
 
 		 93 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  48.89 
 
 		 91 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  44.57 
 
 		 108 aa  87.4  6e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 83 aa  87  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  49.44 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  49.44 
 
 		 91 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 81 aa  87  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 197 aa  87  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  52 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  46.91 
 
 		 82 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  45 
 
 		 204 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  53.33 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 93 aa  84.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  53.75 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  47.5 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0530  ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  42.68 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  49.35 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0665  30S ribosomal protein S16  46.51 
 
 		 101 aa  84  6e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.0000270999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  43.04 
 
 		 195 aa  84  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  39.36 
 
 		 134 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 82 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  46.25 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  50.68 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0996  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.631811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>