More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0271 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  100 
 
 		 80 aa  163  6.9999999999999995e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  61.04 
 
 		 80 aa  97.1  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 85 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 87 aa  95.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  51.25 
 
 		 81 aa  93.6  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 88 aa  93.6  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 86 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  50.65 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0504  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  50.65 
 
 		 90 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 90 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  53.25 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 81 aa  88.2  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 82 aa  87  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  49.35 
 
 		 96 aa  87  8e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  49.33 
 
 		 85 aa  86.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 88 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 92 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 120 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  54.79 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 82 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 83 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 79 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  53.42 
 
 		 119 aa  84.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 89 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 83 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 120 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  84  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  52.05 
 
 		 120 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 83 aa  83.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  43.24 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  45.95 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 86 aa  82  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1941  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 83 aa  82  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  48 
 
 		 86 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 		 90 aa  81.3  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3099  ribosomal protein S16  44.74 
 
 		 93 aa  80.9  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  47.95 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  52.78 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  51.39 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  47.37 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 83 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>