More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1497 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 88 aa  179  9.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  70.59 
 
 		 88 aa  137  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  68.18 
 
 		 88 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  71.26 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  74.7 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  73.49 
 
 		 90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 90 aa  133  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  68.97 
 
 		 90 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  69.41 
 
 		 88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  63.64 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  69.14 
 
 		 81 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  64.71 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  63.53 
 
 		 90 aa  124  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  69.14 
 
 		 86 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  64.71 
 
 		 91 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  71.25 
 
 		 89 aa  119  9e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  65.85 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  58.62 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  65.43 
 
 		 82 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 81 aa  116  9e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  65.06 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 81 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 81 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  60.47 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  57.3 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  57.3 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 		 90 aa  114  6.9999999999999995e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 		 90 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 86 aa  110  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  55.95 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 		 197 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  54.12 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 85 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 192 aa  107  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 81 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  55 
 
 		 204 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 81 aa  105  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 111 aa  105  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 186 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  53.75 
 
 		 85 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 191 aa  98.2  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 175 aa  98.2  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 86 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  48.84 
 
 		 93 aa  98.2  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 188 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 95 aa  98.2  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  58.67 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 82 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 108 aa  95.9  1e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  58.67 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 81 aa  96.7  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 191 aa  95.5  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  94.7  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 79 aa  94.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  54.67 
 
 		 81 aa  94.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 89 aa  92.8  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 195 aa  92.8  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  54.02 
 
 		 107 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  51.72 
 
 		 201 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1092  ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000161695  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 79 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  52.87 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  52.87 
 
 		 110 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  49.4 
 
 		 178 aa  90.1  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0367  30S ribosomal protein S16  52.87 
 
 		 110 aa  89.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 79 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  48.19 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>