More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1384 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  71.52 
 
 		 197 aa  214  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  57.58 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  60.34 
 
 		 119 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  56.46 
 
 		 192 aa  160  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  49.67 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  48.57 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  54.72 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  48.33 
 
 		 146 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  44.52 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 88 aa  106  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 90 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  37.9 
 
 		 135 aa  101  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 91 aa  101  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  36.57 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  37.1 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 88 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 88 aa  99.8  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 135 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 90 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  55 
 
 		 139 aa  99  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 136 aa  97.8  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 136 aa  98.2  7e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 86 aa  97.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 86 aa  97.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  54.65 
 
 		 90 aa  97.8  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 90 aa  97.4  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 133 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 88 aa  97.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 81 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  53.57 
 
 		 90 aa  96.3  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 86 aa  95.9  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 86 aa  95.5  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 153 aa  95.1  5e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  94.7  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1028  ribosomal protein S16  42.28 
 
 		 208 aa  94.4  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 154 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 201 aa  93.6  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  52.38 
 
 		 96 aa  93.2  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 81 aa  92  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 131 aa  92  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 82 aa  92.4  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 91 aa  91.7  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 96 aa  91.7  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 168 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  51.25 
 
 		 85 aa  91.3  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 87 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 82 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 85 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  58.11 
 
 		 81 aa  89.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 88 aa  88.6  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 88 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 88 aa  88.6  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 93 aa  88.2  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 91 aa  88.2  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  48.24 
 
 		 90 aa  88.2  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 82 aa  88.2  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 88 aa  87.8  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 		 146 aa  87.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 152 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 91 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 91 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  59.42 
 
 		 81 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 124 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  55 
 
 		 89 aa  85.5  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 119 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 124 aa  85.1  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 156 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  52.56 
 
 		 159 aa  85.5  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 141 aa  85.1  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 122 aa  85.1  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 95 aa  85.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 142 aa  85.1  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  49.41 
 
 		 120 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 136 aa  85.1  6e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  50 
 
 		 141 aa  85.1  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  51.28 
 
 		 156 aa  84.7  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 81 aa  84.7  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 81 aa  84.7  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  44.86 
 
 		 123 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  84.7  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  44.86 
 
 		 123 aa  84.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 149 aa  84.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 82 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1305  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>