More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4888 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  100 
 
 		 185 aa  351  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  72.28 
 
 		 121 aa  154  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  64.81 
 
 		 123 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  74.23 
 
 		 119 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  63.16 
 
 		 152 aa  147  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  62.04 
 
 		 123 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  73.4 
 
 		 119 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  62.04 
 
 		 123 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  68.37 
 
 		 120 aa  141  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  69.47 
 
 		 122 aa  141  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  65.35 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  65.35 
 
 		 124 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  64 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  64 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  64 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  68.42 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  68.42 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  68.42 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  63.37 
 
 		 141 aa  137  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  65.35 
 
 		 154 aa  136  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  65.35 
 
 		 120 aa  134  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  65.35 
 
 		 134 aa  134  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  65.35 
 
 		 134 aa  134  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  62.38 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  66.34 
 
 		 134 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  64.71 
 
 		 113 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  64.36 
 
 		 134 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  61.05 
 
 		 124 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  62.77 
 
 		 110 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  60.64 
 
 		 107 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  60.64 
 
 		 106 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2780  30S ribosomal protein S16  61.7 
 
 		 110 aa  124  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00569729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  57.29 
 
 		 145 aa  124  7e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  60.87 
 
 		 110 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  60.58 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0222  30S ribosomal protein S16  63.04 
 
 		 110 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.0133225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0367  30S ribosomal protein S16  60.64 
 
 		 110 aa  121  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  58.51 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  57 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0123  ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 85 aa  114  6e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.622663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 122 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 106 aa  103  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 90 aa  99.4  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  55.56 
 
 		 139 aa  99  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 90 aa  98.2  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2019  30S ribosomal protein S16  61.64 
 
 		 89 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.994387 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 86 aa  98.2  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2322  30S ribosomal protein S16  61.64 
 
 		 89 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 87 aa  97.1  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 146 aa  96.7  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 81 aa  96.3  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 87 aa  95.5  4e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  56.16 
 
 		 82 aa  95.5  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 86 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 86 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 91 aa  94.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 81 aa  94  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 83 aa  93.6  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  60 
 
 		 81 aa  94  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 91 aa  93.2  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  54.12 
 
 		 96 aa  93.2  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 86 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 86 aa  92.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 82 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 87 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 83 aa  92.8  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  92.8  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 82 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 85 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 90 aa  92  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 83 aa  92  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  44 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 83 aa  91.7  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 82 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 82 aa  91.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  50 
 
 		 96 aa  91.3  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 137 aa  91.3  7e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 90 aa  90.9  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 86 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0200  30S ribosomal protein S16  56.94 
 
 		 87 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198975  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 81 aa  89.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 128 aa  89.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 83 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 82 aa  89.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 83 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 83 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 83 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>