More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0769 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 81 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  82.72 
 
 		 81 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  77.5 
 
 		 90 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  72.84 
 
 		 139 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  75 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  75 
 
 		 90 aa  130  6.999999999999999e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  75 
 
 		 90 aa  129  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 90 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  71.6 
 
 		 88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  69.14 
 
 		 88 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  72.84 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  70 
 
 		 91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  74.68 
 
 		 90 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 88 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 90 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 81 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 81 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  70 
 
 		 89 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  71.05 
 
 		 81 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 81 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  65.43 
 
 		 81 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  65.43 
 
 		 88 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  67.5 
 
 		 85 aa  118  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 92 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  67.09 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  65 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 86 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  62.5 
 
 		 96 aa  111  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  65 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  63.29 
 
 		 82 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 81 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 91 aa  107  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  64.47 
 
 		 79 aa  106  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  64 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  67.95 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 87 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  62.2 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  67.95 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 108 aa  103  7e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  64.47 
 
 		 79 aa  103  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 188 aa  103  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 88 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  63.16 
 
 		 79 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  65.75 
 
 		 80 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  64 
 
 		 81 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  62.82 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 201 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 204 aa  102  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 191 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 197 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  60.71 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 192 aa  100  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  64.1 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  62.82 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 119 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  59.21 
 
 		 79 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 		 130 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  57.89 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 191 aa  98.2  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2223  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000817151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>