More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0968 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  100 
 
 
81 aa  164  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  78.75 
 
 
86 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  75 
 
 
82 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 
81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  69.14 
 
 
90 aa  124  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  70.37 
 
 
81 aa  122  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  69.14 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  67.5 
 
 
89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  67.9 
 
 
90 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  65.43 
 
 
92 aa  117  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  63.75 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  66.25 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  62.96 
 
 
90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 
81 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 
81 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  62.96 
 
 
90 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  65.43 
 
 
85 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  62.5 
 
 
139 aa  113  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 
90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  65.38 
 
 
96 aa  111  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  62.96 
 
 
81 aa  111  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  62.96 
 
 
90 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  58.75 
 
 
91 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  60.49 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  58.23 
 
 
81 aa  105  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  63.64 
 
 
81 aa  105  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  61.25 
 
 
81 aa  106  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  60.49 
 
 
88 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 
87 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 
91 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  61.25 
 
 
146 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 
85 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0224  ribosomal protein S16  58.97 
 
 
154 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 
90 aa  101  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 
91 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 
91 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 
91 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 
90 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  58.33 
 
 
201 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  60.26 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  58.97 
 
 
156 aa  99  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  61.54 
 
 
159 aa  98.6  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 
95 aa  98.6  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  55.56 
 
 
96 aa  99.4  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 
95 aa  98.6  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 
79 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  60.26 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  56.79 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 
90 aa  97.8  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  61.25 
 
 
83 aa  97.8  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 
79 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 
95 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  58.54 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 
192 aa  96.3  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  56.41 
 
 
178 aa  96.3  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
111 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
86 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 
79 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
86 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  55.7 
 
 
191 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 
183 aa  95.1  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  53.16 
 
 
95 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  55.84 
 
 
81 aa  95.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  58.97 
 
 
174 aa  94.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 
79 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  56.96 
 
 
82 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  51.25 
 
 
204 aa  94.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 
154 aa  94  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  56.41 
 
 
95 aa  93.6  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  53.16 
 
 
86 aa  94  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  56.41 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
156 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
152 aa  93.6  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  57.69 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  56.41 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  53.25 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 
86 aa  92.4  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39161  Putative mitochondrial ribosomal protein S16  53.01 
 
 
102 aa  92  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 
119 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>