More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2117 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 192 aa  376  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  64.06 
 
 		 204 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  55 
 
 		 191 aa  164  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  48.9 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  55.33 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  63.21 
 
 		 146 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  56.6 
 
 		 119 aa  137  7.999999999999999e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  63.29 
 
 		 88 aa  114  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  58.75 
 
 		 139 aa  111  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 153 aa  109  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 87 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 88 aa  108  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 90 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 90 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  58.14 
 
 		 90 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  58.75 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 		 90 aa  105  6e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  54.65 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  60.98 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 88 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  59.46 
 
 		 81 aa  101  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 86 aa  101  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 		 90 aa  101  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  59.21 
 
 		 81 aa  101  8e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 81 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 91 aa  101  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1028  ribosomal protein S16  42.06 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  49.52 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 85 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 82 aa  99.8  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0326  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.679786 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 90 aa  99.4  3e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 88 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 135 aa  99  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 90 aa  99  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  99  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  54.43 
 
 		 90 aa  98.6  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  56.79 
 
 		 91 aa  98.2  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 91 aa  98.2  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  44.23 
 
 		 195 aa  97.8  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 81 aa  97.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 81 aa  97.8  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 133 aa  97.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  54.76 
 
 		 96 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 86 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 86 aa  97.1  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 88 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 88 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 89 aa  96.3  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 91 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  55.13 
 
 		 146 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 91 aa  95.5  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 86 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 93 aa  94.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 82 aa  94.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 96 aa  94.4  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 128 aa  93.2  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 82 aa  92.8  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 135 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 141 aa  92.8  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 131 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 168 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 152 aa  92.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  52.56 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 136 aa  91.7  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 88 aa  92  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  53.85 
 
 		 149 aa  91.3  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 82 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 95 aa  90.5  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  52.56 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 136 aa  90.1  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 136 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 82 aa  90.1  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 92 aa  89.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 81 aa  89.4  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 81 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 81 aa  89  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 142 aa  89  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 81 aa  89  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 93 aa  88.6  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0542  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 82 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000153303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5926  ribosomal protein S16  50 
 
 		 145 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.277333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4008  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 145 aa  88.2  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  50 
 
 		 89 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  50 
 
 		 156 aa  87.8  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 95 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>