More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1485 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  100 
 
 
139 aa  280  7.000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  77.78 
 
 
90 aa  157  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  76.67 
 
 
90 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  71.11 
 
 
90 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  67.03 
 
 
91 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  67.03 
 
 
91 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 
90 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  66.67 
 
 
90 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  65.56 
 
 
90 aa  137  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  64.44 
 
 
90 aa  135  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  72.84 
 
 
81 aa  134  5e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  63.54 
 
 
96 aa  133  6.0000000000000005e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  66.67 
 
 
90 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  64.37 
 
 
88 aa  130  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  67.44 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  70 
 
 
81 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  70.37 
 
 
86 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  61.36 
 
 
88 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  64.71 
 
 
88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 
81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 
81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  70.73 
 
 
85 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 
91 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  66.67 
 
 
82 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 
91 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  65.17 
 
 
89 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 
91 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  57.95 
 
 
88 aa  118  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  62.5 
 
 
146 aa  117  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  62.96 
 
 
81 aa  116  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  62.65 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 
88 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  65 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  64.94 
 
 
81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 
87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  53.85 
 
 
92 aa  114  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  58.14 
 
 
86 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  58.14 
 
 
96 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 
81 aa  113  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 
183 aa  112  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 
88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  58.54 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 
95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  60 
 
 
81 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  52.48 
 
 
204 aa  110  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 
192 aa  110  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  60.26 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  60.26 
 
 
86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  59.49 
 
 
81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  54.37 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  64.94 
 
 
81 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  50.48 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  55.95 
 
 
191 aa  107  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  60.98 
 
 
120 aa  107  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  58.23 
 
 
82 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 
119 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 
134 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 
120 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  60.98 
 
 
120 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 
134 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  60.98 
 
 
120 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 
119 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  53.57 
 
 
197 aa  104  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3276  30S ribosomal protein S16  50.96 
 
 
113 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256511  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  50.56 
 
 
95 aa  104  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  50.56 
 
 
95 aa  104  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  49.04 
 
 
188 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  50.98 
 
 
134 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  58.97 
 
 
191 aa  103  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  50.59 
 
 
111 aa  103  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  58.62 
 
 
86 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  54.29 
 
 
141 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  58.62 
 
 
86 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  52.88 
 
 
130 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  45.16 
 
 
185 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  51.69 
 
 
95 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  60.76 
 
 
84 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  51.04 
 
 
95 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  49.51 
 
 
130 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  48.86 
 
 
90 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  57.69 
 
 
93 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 
123 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  51.69 
 
 
89 aa  101  3e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  42.59 
 
 
195 aa  101  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  48.54 
 
 
201 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  49.02 
 
 
134 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  47.73 
 
 
134 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  53.41 
 
 
128 aa  101  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>