More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0656 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  71.43 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 89 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  66.27 
 
 		 90 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  65.06 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  63.22 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 88 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  65.43 
 
 		 81 aa  117  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  65 
 
 		 86 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  59.14 
 
 		 96 aa  116  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 90 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 90 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  55.68 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 88 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  63.75 
 
 		 82 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  54.95 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  66.67 
 
 		 85 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  57.32 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 90 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 81 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 81 aa  107  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  56.82 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  56.82 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  56.47 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  55.42 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  50.57 
 
 		 90 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  51.81 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 81 aa  100  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  51.14 
 
 		 88 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 88 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 86 aa  98.6  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 81 aa  97.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  60.26 
 
 		 178 aa  97.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1561  SSU ribosomal protein S16P  55.68 
 
 		 174 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0890595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  55 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 86 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  53.33 
 
 		 156 aa  94.7  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 86 aa  93.6  9e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  54.22 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  47.83 
 
 		 195 aa  92.8  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  50.59 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1167  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 142 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3423  ribosomal protein S16  53.49 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 197 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0979  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.924715  normal  0.291876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1827  ribosomal protein S16  51.14 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0861324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  51.14 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 93 aa  91.3  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1470  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.935451  normal  0.120504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2483  SSU ribosomal protein S16P  55.42 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0481662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0662  SSU ribosomal protein S16P  56.41 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.646804  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23750  SSU ribosomal protein S16P  56.41 
 
 		 149 aa  90.9  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  44.57 
 
 		 204 aa  90.9  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09970  SSU ribosomal protein S16P  57.69 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.226253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1512  ribosomal protein S16  53.01 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819052  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  50 
 
 		 95 aa  90.1  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  50 
 
 		 201 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  48.78 
 
 		 191 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2540  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.212486  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 192 aa  89  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 95 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>