More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1229 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  71.74 
 
 		 95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  68.6 
 
 		 90 aa  128  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  61.96 
 
 		 111 aa  124  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  57.95 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 		 90 aa  110  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  56.82 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  58.43 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  56.82 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  56.82 
 
 		 90 aa  106  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  51.09 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  52.17 
 
 		 96 aa  106  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  53.41 
 
 		 90 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 		 88 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  52.22 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  53.41 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  53.41 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  49.43 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  52.27 
 
 		 90 aa  100  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  52.81 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  54.12 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 81 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 81 aa  97.4  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  49.41 
 
 		 88 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  53.75 
 
 		 90 aa  95.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  50.6 
 
 		 88 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  50.56 
 
 		 91 aa  93.2  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  50.56 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  50.56 
 
 		 91 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  51.22 
 
 		 183 aa  91.3  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 96 aa  91.3  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  53.16 
 
 		 81 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1483  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 82 aa  90.5  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0143282  normal  0.756765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  55.13 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  44.58 
 
 		 87 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  61.33 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  61.33 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  61.33 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0530  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 86 aa  87.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  50 
 
 		 83 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  44.09 
 
 		 93 aa  87  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  50 
 
 		 191 aa  87  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0996  30S ribosomal protein S16  58.67 
 
 		 75 aa  86.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.631811  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  47.42 
 
 		 146 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 86 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 85 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  54.05 
 
 		 80 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 79 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  50 
 
 		 80 aa  84.3  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  47.56 
 
 		 197 aa  84  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  45.57 
 
 		 81 aa  84  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  50.65 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0200  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 87 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198975  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  43.16 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  44.9 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  48.19 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  46.25 
 
 		 82 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  42.68 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  48.75 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1007  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0103169  normal  0.256823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0557  ribosomal protein S16  54.93 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.611754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  43.75 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  49.4 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1038  30S ribosomal protein S16  59.09 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0520033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  44.3 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  45.95 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2006  ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  80.5  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000332773  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  43.43 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  42.5 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2322  30S ribosomal protein S16  41.24 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>