More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1328 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  100 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 183 aa  151  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  56.3 
 
 		 191 aa  147  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  52.8 
 
 		 204 aa  144  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  63.21 
 
 		 192 aa  142  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 188 aa  137  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  57.94 
 
 		 197 aa  130  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  48.33 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  43.8 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  63.22 
 
 		 90 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  63.1 
 
 		 91 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  62.5 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  50.44 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 		 90 aa  114  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  59.77 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  58.82 
 
 		 90 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  65 
 
 		 85 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 91 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  57.65 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 		 90 aa  107  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  60 
 
 		 86 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 96 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  63.51 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 81 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  60 
 
 		 96 aa  105  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 87 aa  104  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 82 aa  103  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 92 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  55 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  54.76 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  46.85 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  62.16 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  62.2 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 86 aa  100  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 91 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  56.96 
 
 		 90 aa  100  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 128 aa  99.4  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  46.83 
 
 		 195 aa  99.8  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  55 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  48.28 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 88 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 81 aa  99.8  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 81 aa  99.4  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  40.97 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  56.63 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 89 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  47.71 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  45.22 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  57.89 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  48.11 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 201 aa  95.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 119 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 		 114 aa  94  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 185 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl542  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000264239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 107 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>