More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2855 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 86 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 86 aa  174  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  73.68 
 
 		 80 aa  114  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  66.23 
 
 		 83 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3401  30S ribosomal protein S16  64.94 
 
 		 83 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  64.94 
 
 		 83 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  64.94 
 
 		 83 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  64.94 
 
 		 83 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  65.79 
 
 		 83 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  63.16 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  63.16 
 
 		 83 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  63.22 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0392  ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  60.98 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  64.94 
 
 		 83 aa  104  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  63.16 
 
 		 79 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  63.64 
 
 		 82 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 81 aa  102  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  62.2 
 
 		 106 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  62.2 
 
 		 110 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 82 aa  102  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  60.98 
 
 		 107 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  58.62 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  54.88 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  58.67 
 
 		 87 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  56.79 
 
 		 85 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0367  30S ribosomal protein S16  60.98 
 
 		 110 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.444228 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 181 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  62.03 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1402  ribosomal protein S16  63.64 
 
 		 83 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  63.16 
 
 		 84 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3770  ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 82 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000378706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2006  ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000332773  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  63.64 
 
 		 83 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  62.82 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2540  30S ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0200  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 87 aa  98.2  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198975  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 83 aa  98.6  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 90 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 82 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 83 aa  97.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 90 aa  97.4  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 83 aa  97.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 84 aa  97.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 81 aa  97.4  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 84 aa  97.1  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0222  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 110 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.932871  normal  0.0133225 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 82 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 83 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  61.04 
 
 		 84 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 91 aa  97.1  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  61.04 
 
 		 82 aa  97.1  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 82 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 82 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 83 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  55.7 
 
 		 96 aa  96.7  9e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 90 aa  96.7  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1065  ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000286149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3848  30S ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000663881  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 86 aa  95.9  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 86 aa  95.9  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 83 aa  96.7  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2768  30S ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2761  30S ribosomal protein S16  59.74 
 
 		 82 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377761  normal  0.0321443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1884  30S ribosomal protein S16  67.61 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 90 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  59.21 
 
 		 83 aa  96.3  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>