More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3770 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3770  ribosomal protein S16  100 
 
 		 82 aa  167  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000378706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  73.17 
 
 		 82 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  74.39 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  72.84 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  74.39 
 
 		 83 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  75 
 
 		 83 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  75.61 
 
 		 83 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  73.17 
 
 		 83 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  73.17 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  73.75 
 
 		 83 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  70.73 
 
 		 83 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  70.89 
 
 		 81 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  71.95 
 
 		 82 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  71.95 
 
 		 82 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0095  30S ribosomal protein S16  73.17 
 
 		 82 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03480  30S ribosomal protein S16  73.17 
 
 		 82 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  73.17 
 
 		 82 aa  127  5.0000000000000004e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 83 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002536  SSU ribosomal protein S16p  71.95 
 
 		 82 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.01225  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 83 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  70.73 
 
 		 82 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 83 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 83 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 83 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  70.73 
 
 		 82 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  73.08 
 
 		 79 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  68.29 
 
 		 82 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  68.29 
 
 		 82 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01705  30S ribosomal protein S16  69.51 
 
 		 83 aa  124  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.397905  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0649  30S ribosomal protein S16  71.95 
 
 		 96 aa  123  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0268123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  67.07 
 
 		 82 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  67.07 
 
 		 82 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  67.07 
 
 		 82 aa  123  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  67.07 
 
 		 82 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 83 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  68.29 
 
 		 82 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 83 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  70.13 
 
 		 82 aa  120  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 86 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 86 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  66.25 
 
 		 83 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2860  ribosomal protein S16  65.85 
 
 		 82 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0647  ribosomal protein S16  66.25 
 
 		 80 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.596483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  67.53 
 
 		 83 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0392  ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 84 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  66.23 
 
 		 83 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  66.23 
 
 		 83 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  66.23 
 
 		 83 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  64.2 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2006  ribosomal protein S16  69.51 
 
 		 86 aa  117  7e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000332773  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02498  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0245657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1065  ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000286149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1074  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0314963  normal  0.014008 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2768  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000347369  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2761  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377761  normal  0.0321443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2998  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00134476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3848  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000663881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2893  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000112425  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02462  hypothetical protein  64.63 
 
 		 82 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1473  ribosomal protein S16  65.43 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.34731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1282  30S ribosomal protein S16  65.43 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2890  30S ribosomal protein S16  63.41 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3004  30S ribosomal protein S16  63.41 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0878334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2871  30S ribosomal protein S16  63.41 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.958206  normal  0.0386254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2892  30S ribosomal protein S16  63.41 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  0.381108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2821  30S ribosomal protein S16  63.41 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3401  30S ribosomal protein S16  66.23 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  67.09 
 
 		 80 aa  114  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3090  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 82 aa  113  8.999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.248883  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1019  30S ribosomal protein S16  63.41 
 
 		 83 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247082  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0681  30S ribosomal protein S16  67.95 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1104  30S ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 86 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0846  ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2019  30S ribosomal protein S16  60.98 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.994387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2322  30S ribosomal protein S16  60.98 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0530  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 86 aa  110  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0200  30S ribosomal protein S16  64.47 
 
 		 87 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198975  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02147  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918801  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5345  ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 84 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3066  SSU ribosomal protein S16P  61.84 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618527  hitchhiker  0.000000496657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0073  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0087  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 86 aa  103  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2334  SSU ribosomal protein S16P  59.76 
 
 		 82 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  0.0568349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0427  ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0198  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 107 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2781  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 83 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 106 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  57.32 
 
 		 83 aa  100  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1461  ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  61.33 
 
 		 110 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  58.54 
 
 		 109 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 86 aa  99.8  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 84 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>