More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1374 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1374  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 83 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.696619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15970  30S ribosomal protein S16  98.8 
 
 		 83 aa  169  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0228176  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  90.36 
 
 		 83 aa  158  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3401  30S ribosomal protein S16  96.1 
 
 		 83 aa  157  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.587693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1462  30S ribosomal protein S16  88.31 
 
 		 83 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.065689  normal  0.177487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4259  30S ribosomal protein S16  88.31 
 
 		 83 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4157  30S ribosomal protein S16  88.31 
 
 		 83 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29802  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1067  30S ribosomal protein S16  88.31 
 
 		 83 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1019  30S ribosomal protein S16  75.9 
 
 		 83 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.247082  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2280  30S ribosomal protein S16  79.49 
 
 		 79 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111517  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1203  30S ribosomal protein S16  75.31 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00503973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1473  ribosomal protein S16  73.49 
 
 		 85 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.34731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1282  30S ribosomal protein S16  72.29 
 
 		 85 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3016  SSU ribosomal protein S16P  72.29 
 
 		 83 aa  125  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00108733  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2006  ribosomal protein S16  69.14 
 
 		 86 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000332773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3770  ribosomal protein S16  68.75 
 
 		 82 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000378706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  68.67 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2260  ribosomal protein S16  69.74 
 
 		 80 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0142579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0889  30S ribosomal protein S16  65.06 
 
 		 83 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000979344  normal  0.306742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0991  30S ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 82 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0194612  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2754  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000698821  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3203  30S ribosomal protein S16  65.43 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00186632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2920  30S ribosomal protein S16  65.06 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000279747  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1063  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1210  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011785  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0392  ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1049  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  115  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1254  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000963986  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1287  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000457134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3103  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  normal  0.216318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1124  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 82 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1254  30S ribosomal protein S16  65.06 
 
 		 83 aa  115  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000403035  hitchhiker  0.0000450288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1168  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3364  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0117785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0882  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.256318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3228  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.132458  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4069  ribosomal protein S16  62.96 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00170773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2860  ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1159  30S ribosomal protein S16  63.86 
 
 		 83 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000121606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0852  30S ribosomal protein S16  64.2 
 
 		 82 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000804578  hitchhiker  0.000061806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  59.04 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0530  ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 86 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1357  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0846  ribosomal protein S16  60.98 
 
 		 84 aa  110  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3017  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 82 aa  110  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000030824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1006  30S ribosomal protein S16  65.85 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2977  30S ribosomal protein S16  65.85 
 
 		 84 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0408161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2838  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2920  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 82 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00011068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1577  30S ribosomal protein S16  62.65 
 
 		 83 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.473483  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0466  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0442  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0293  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000010375  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  63.16 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2234  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.579388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  63.16 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0552  30S ribosomal protein S16  56.79 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.62972e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002536  SSU ribosomal protein S16p  61.73 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.01225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4183  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0590  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03480  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0945  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1028  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1069  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0345994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0949  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0228  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2545  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.142898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2859  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0403  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2968  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1629  30S ribosomal protein S16  56.79 
 
 		 181 aa  107  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000966466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1661  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0919  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2919  30S ribosomal protein S16  64.63 
 
 		 84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3090  30S ribosomal protein S16  61.73 
 
 		 82 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.248883  normal  0.0593615 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2890  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 82 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0294051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2871  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 82 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.958206  normal  0.0386254 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3004  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 82 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0878334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2892  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 82 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.155389  normal  0.381108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2821  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 82 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00742306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0095  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 82 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000315992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01705  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.397905  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0769  30S ribosomal protein S16  63.41 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0933  30S ribosomal protein S16  60.24 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.054663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0804  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0875  30S ribosomal protein S16  61.45 
 
 		 84 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02498  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0245657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1065  ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000286149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2761  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0377761  normal  0.0321443 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3848  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000663881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3367  ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2998  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00134476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02462  hypothetical protein  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0748  30S ribosomal protein S16P  62.65 
 
 		 109 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2768  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000347369  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1074  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0314963  normal  0.014008 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2893  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000112425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0569  30S ribosomal protein S16  60.53 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.495753  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1690  SSU ribosomal protein S16P  62.2 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0198  ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>