More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2997 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  100 
 
 		 86 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  69.23 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  66.67 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 91 aa  110  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  60.26 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 81 aa  105  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  59.3 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  61.54 
 
 		 82 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  65.38 
 
 		 130 aa  104  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 90 aa  104  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  62.82 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  58.62 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  64.1 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  64.47 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  56.41 
 
 		 85 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 79 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  57.69 
 
 		 96 aa  98.6  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 88 aa  98.2  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 201 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  54.67 
 
 		 81 aa  97.4  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 141 aa  97.4  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 79 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  58.97 
 
 		 186 aa  97.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 81 aa  97.8  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_004310  BR1824  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  59.21 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1756  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 134 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  58.02 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 91 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  55 
 
 		 81 aa  96.7  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  57.83 
 
 		 154 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 91 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0069  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0915038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 116 aa  95.9  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  54.22 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 192 aa  95.5  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2153  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.399128  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 92 aa  95.9  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  53.85 
 
 		 90 aa  95.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 124 aa  94.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  57.89 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 197 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 81 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 81 aa  93.6  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 119 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1405  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.321443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3339  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4888  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 185 aa  92.8  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 195 aa  91.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  53.85 
 
 		 88 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4075  30S ribosomal protein S16  45.68 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  53.85 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  54.32 
 
 		 122 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3752  30S ribosomal protein S16  45.68 
 
 		 123 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.411853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  50.62 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 183 aa  90.9  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1185  30S ribosomal protein S16  55.68 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.426225  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 96 aa  90.9  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0798  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 106 aa  90.5  6e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0129  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 87 aa  90.9  6e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  53.33 
 
 		 81 aa  90.5  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 83 aa  90.5  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0192  30S ribosomal protein S16  58.23 
 
 		 87 aa  90.5  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  49.38 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>