More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2025 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  100 
 
 		 81 aa  168  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  69.14 
 
 		 81 aa  121  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  65.79 
 
 		 79 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  64.56 
 
 		 79 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  67.11 
 
 		 79 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1803  30S ribosomal protein S16  61.84 
 
 		 79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.013631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  59.21 
 
 		 81 aa  100  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  55.84 
 
 		 81 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 90 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  55 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  55 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  54.55 
 
 		 90 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 86 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  51.95 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2607  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.152085  normal  0.0124083 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  51.95 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  51.32 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  53.75 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  52.63 
 
 		 90 aa  90.9  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 85 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  48.05 
 
 		 81 aa  90.5  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 87 aa  90.5  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 90 aa  90.1  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1447  ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 90 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 89 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  46.75 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  52 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  48.65 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  50 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0348  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  51.95 
 
 		 91 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1153  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 86 aa  87.8  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1501  ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 83 aa  87.4  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.019119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1398  ribosomal protein S16  50 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  50.65 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0884  SSU ribosomal protein S16P  46.25 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2896  SSU ribosomal protein S16P  55.56 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  50.67 
 
 		 95 aa  87  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0073  30S ribosomal protein S16  48.72 
 
 		 86 aa  86.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  50 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  51.35 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0271  ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 80 aa  86.3  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000138146  normal  0.906741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 92 aa  86.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00310  SSU ribosomal protein S16P  50.67 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000491979  decreased coverage  0.00000000000378635 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  49.37 
 
 		 81 aa  85.9  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0087  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 86 aa  85.1  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  49.35 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 84 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3097  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.458494  normal  0.937059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  48.05 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  48.68 
 
 		 82 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  46.05 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  50 
 
 		 88 aa  83.6  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  47.22 
 
 		 86 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  47.3 
 
 		 91 aa  82.8  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  45.45 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2709  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0297256 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0810  30S ribosomal protein S16  52.78 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.753597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1048  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 116 aa  82  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.49402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  46.75 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0733  30S ribosomal protein S16  52.78 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.140851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39560  30S ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 83 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.768221  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0181  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1296  30S ribosomal protein S16  52.78 
 
 		 75 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1079  30S ribosomal protein S16  46.84 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0578935  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0530  ribosomal protein S16  46.15 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  46.67 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11040  SSU ribosomal protein S16P  45.95 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0237253  normal  0.066804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09150  SSU ribosomal protein S16P  47.3 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.791565  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0681  30S ribosomal protein S16  47.44 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0547  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3579  30S ribosomal protein S16  44.05 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.41568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  45.33 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  44.59 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3881  30S ribosomal protein S16  48.15 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.177268  normal  0.897477 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0200  30S ribosomal protein S16  47.89 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198975  normal  0.0587542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  44.44 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4205  30S ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.847506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>