More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2055 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  100 
 
 		 89 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  81.25 
 
 		 88 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  70.73 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 88 aa  124  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  65.17 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 81 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 		 90 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  72.5 
 
 		 81 aa  121  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  68.35 
 
 		 90 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  120  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 81 aa  119  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  76.25 
 
 		 81 aa  119  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 		 88 aa  119  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 90 aa  119  9e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  71.25 
 
 		 90 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  70 
 
 		 90 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  67.5 
 
 		 81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  61.18 
 
 		 96 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 91 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 91 aa  110  5e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2408  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000382163  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  60 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  57.5 
 
 		 82 aa  107  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  61.25 
 
 		 90 aa  106  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  60 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0716  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 88 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  62.5 
 
 		 85 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  60.81 
 
 		 81 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  60.49 
 
 		 91 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  58.75 
 
 		 87 aa  101  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  62.34 
 
 		 81 aa  101  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  60.76 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  64.47 
 
 		 95 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  59.26 
 
 		 91 aa  99.4  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  59.49 
 
 		 88 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 146 aa  97.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3305  ribosomal protein S16  54.43 
 
 		 81 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 86 aa  96.7  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  60.26 
 
 		 86 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  55.56 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 197 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  53.33 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  54.44 
 
 		 119 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  54.44 
 
 		 120 aa  93.6  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0646  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 90 aa  93.2  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  52.22 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  48.75 
 
 		 204 aa  91.7  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1229  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  55.13 
 
 		 95 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  51.11 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 183 aa  90.5  7e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1287  ribosomal protein S16  50 
 
 		 95 aa  90.1  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.889562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  52.22 
 
 		 107 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2887  30S ribosomal protein S16  55.26 
 
 		 79 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  51.11 
 
 		 106 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  51.81 
 
 		 191 aa  89.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  54.44 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2025  ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000392366  normal  0.0104179 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  52.7 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  50 
 
 		 201 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0985  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000245762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3682  ribosomal protein S16  51.9 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2278  ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00221023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0749  30S ribosomal protein S16  51.11 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 195 aa  88.2  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1099  30S ribosomal protein S16  53.95 
 
 		 79 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.280704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2672  ribosomal protein S16  51.19 
 
 		 89 aa  88.2  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00262741  hitchhiker  0.000000230838 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2142  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 79 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1419  ribosomal protein S16  51.11 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.206604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1666  ribosomal protein S16  50 
 
 		 93 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00967781  hitchhiker  0.00350305 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 192 aa  87.4  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  53.25 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>